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食用菌瓶子与食用菌菌种瓶都是用于种植和保存食用菌的容器，但它们之间存在一些区别。
食用菌瓶子一般用于种植食用菌，通常具有较大的开口，便于添加培养基和接种菌种，同时也方便进行空气交换和观察菌类的生长情况，这些瓶子通常是由耐用的塑料或玻璃制成，能够承受高压蒸汽消毒等处理方式，以确保瓶子的无菌状态，这些瓶子通常具有足够的空间来容纳大量的培养基和菌类生长所需的营养。
而食用菌菌种瓶则主要用于保存和运输菌种，这些瓶子通常具有较小的开口，并且配备有密封性能良好的盖子，以确保菌种不会受到外部环境的污染，菌种瓶通常采用高质量的玻璃或不锈钢制成，能够承受长时间的保存和运输过程中的压力和温度变化，这些瓶子通常具有较小的容量，仅容纳少量的培养基和菌种。
食用菌瓶子主要用于种植菌类，而食用菌菌种瓶则主要用于保存和运输菌种，两者在设计和使用方面有所不同，以满足不同的需求。